외막 유틸리티는 장내 박테로이데테스(Bacteroidetes)에서 글리칸 흡수를 중재합니다

네이처(2023)이 기사 인용

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박테로이데테스는 인간 미생물총의 풍부한 구성원으로, 말단 장에서 수많은 식이 및 숙주 유래 글리칸을 활용합니다1. 이들 박테리아의 박테리아 외막을 통한 글리칸 흡수는 막 내장 배럴과 지단백질 덮개로 구성된 SusCD 단백질 복합체에 의해 매개되며, 이는 기질 결합 및 수송을 촉진하기 위해 열리고 닫히는 것으로 생각됩니다. 그러나 표면에 노출된 글리칸 결합 단백질과 글리코시드 가수분해효소도 큰 글리칸 사슬의 포획, 처리 및 수송에 중요한 역할을 합니다. 결장 미생물군에 의한 영양분 획득에 결정적인 역할을 함에도 불구하고 외막에 있는 이러한 구성 요소 간의 상호 작용은 잘 알려져 있지 않습니다. 여기서 우리는 Bacteroides thetaiotaomicron의 levan 및 dextran 활용 시스템 모두에 대해 추가적인 외부 막 구성 요소가 핵심 SusCD 수송체에 조립되어 우리가 utilisome이라고 부르는 안정적인 글리칸 활용 기계를 형성한다는 것을 보여줍니다. 기질의 유무에 따른 단일 입자 극저온 전자 현미경 구조는 기질 포획 메커니즘을 입증하고 유틸리솜에서 각 구성 요소의 역할을 합리화하는 일치된 형태 변화를 나타냅니다.

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이 연구 결과를 뒷받침하는 데이터는 합당한 요청이 있을 경우 해당 저자에게 제공됩니다. Cryo-EM 재구성 및 해당 좌표는 각각 전자 현미경 데이터 뱅크 및 PDB에 보관되었습니다. 기판이 없는 레반 유틸리티(EMD-15288 및 PDB 8A9Y), FOS DP 8–12가 있는 레반 유틸리티(EMD-15289 및 PDB) 8AA0), FOS DP 8–12(EMD-15290 및 PDB 8AA1)가 있는 levan 유틸리티의 SusC2D2 코어, FOS DP 15–25(EMD-15291 및 PDB 8AA2)가 있는 비활성 levan 유틸리티, FOS가 있는 비활성 levan 유틸리티의 SusC2D2 코어 DP 15–25(EMD-1592 및 PDB 8AA3), dextran 유용한 합의 개선(EMD-15293 및 PDB 8AA4). GHlev에 대한 X선 결정학 실험의 좌표 및 구조 요인은 액세스 코드 7ZNR 및 7ZNS로 PDB에 기탁되었습니다. 질량 분석기 프로테오믹스 데이터는 데이터 세트 식별자 PXD034863을 사용하여 PRIDE 파트너 저장소를 통해 ProteomeXchange 컨소시엄에 기탁되었습니다. 이 연구의 원시 데이터는 University of Leeds Data Repository(https://doi.org/10.5518/1329)에서 확인할 수 있습니다. 이 문서에는 원본 데이터가 제공됩니다.

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